La fontaine comprend un bassin rectangulaire étroit et profond de 2 mètres, contenant 900 litres d'eau. Elle est entourée de murets. Le mur enterré est construit en moellons de granite alors que les murs et le fronton sont édifiés en pierre de taille.

Le mur du fond de la fontaine est surélevé avec un fronton triangulaire évidé d'une niche à statuette surmontée des armes des seigneurs de Kermarquer et couronné d'une croix latine, légèrement amputée côté droit. La statuette initiale a disparu. Elle est remplacée de nos jours, par une statuette de substitution.

Le bassin de la fontaine est protégé d'une grille.

La fontaine de Notre Dame de Bouan est une fontaine de dévotion et de croyances.

Le vocable breton 'Bouan' ou 'Boan' signifie la douleur, la souffrance. Il est aussi associé au nom d'une herbe sauvage, dite 'mauvaise herbe' ou 'adventice'.

La fontaine est réputée guérir les enfants dont les membres inférieurs sont malades ou atrophiés, et qui de ce fait, ont du mal à marcher. L'mage d'une mère menant ses enfants malades à la fontaine est représentée sur un vitrail de la chapelle.

Cette fontaine était enfouie et enterrée sous la végétation avant que la même association locale qui a rénovée  la chapelle la découvre et la réhabilite en 1997. La fontaine native daterait du XVIIème siècle.